古今東西の人気アニメ作品の展示が年数回入れ替えで開催される企画展示室を設置。
展示室と併設されたグッズストアでは、企画展に関連した商品や、さまざまなアニメ関連商品もラインナップ。
また、ぬい撮りができるオリジナルぬい撮りスポットも併設しています。

天井吹き抜けには、約120点のアニメキャラクターやシーンをらせん状に繋ぎ、「アニメの現在と未来」をイメージしたシンボルオブジェがみなさんをお出迎えします。
来場者が自由にメッセージを残せるメッセージボードや、東京アニメ観光に便利なインタラクティブウォールではここでしか見る事が出来ない映像も多数再生中。
コミュニティスペースとなるこのフロアー「総合情報プラットフォーム」は、来場者の方々がアニメについてゆっくり語り合い、交流できるスペースとなっています。

地下１階ではアニメ資料の保存を行い、それらを使用してアニメの制作工程を学べる常設展示と、アーカイブ展示ではアニメ制作会社が保有しているアニメ関連資料を定期的に入れ替え展示しています。
また、アニメに関連するワークショップなどの体験イベントも開催しています。このフロアーではアニメについてより深く知る事が出来る場所となっています。